El Instituto contará con la siguiente estructura:

Unidad de Gestión: Donde se ubicará al personal de gestión incluida la dirección de gestión.

Servicios Científicos – Técnicos: Aquí estarán los distintos laboratorios por ejemplo el de cultivos celulares, el Centro Nacional de Gripe, el laboratorio de impresión en 3D, etc…

Unidad de Ensayos Clínicos: con sus correspondientes apartados (zona de recepción de pacientes, sala de espera, consultas, sala de medicación, hospital de día, gabinetes para pruebas específicas, almacén, sala blanca, etc…)

Espacios compartidos con el Hospital: El Instituto compartirá con el hospital la Sala de Juntas y el Salón de Actos.